Programa do Curso

Introdução à linguagem de programação Python

  • Porquê Python?
  • Usando Python para lidar com dados biológicos
  • Trabalhar com a shell iPython
  • O seu primeiro programa
  • Escrever scripts Python
  • Importando módulos

Trabalhar com sequências de proteínas e RNA/DNA

  • Encontrar motivos
  • Transcrição e tradução in silico
  • Manipulação de alinhamentos de sequências

Analisar dados em diferentes formatos biológicos

  • Análise de FASTA
  • Conversão de formatos de dados

Execução de análises biológicas

  • BLAST
  • Serviços Web biológicos Access

Lidar com estruturas biológicas 3D utilizando Python

Python facilita a análise estatística

Visualizar dados

  • Criar gráficos de barras e de dispersão
  • Cálculo de uma área sob a curva (AUC)

Trabalhar com ficheiros .xls e .csv

  • Importar dados de e exportar para o MS Excel / OpenOffice Calc
  • Escrever ficheiros .xls e .csv

Utilizar Python para criar um pipeline de processamento de dados automatizado

Requisitos

Conhecimentos biológicos básicos sobre sequências de proteínas, ARN e ADN.

 28 Horas

Declaração de Clientes (1)

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