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Programa do Curso
Introdução à linguagem de programação Python
- Porquê Python?
- Usando Python para lidar com dados biológicos
- Trabalhar com a shell iPython
- O seu primeiro programa
- Escrever scripts Python
- Importando módulos
Trabalhar com sequências de proteínas e RNA/DNA
- Encontrar motivos
- Transcrição e tradução in silico
- Manipulação de alinhamentos de sequências
Analisar dados em diferentes formatos biológicos
- Análise de FASTA
- Conversão de formatos de dados
Execução de análises biológicas
- BLAST
- Serviços Web biológicos Access
Lidar com estruturas biológicas 3D utilizando Python
Python facilita a análise estatística
Visualizar dados
- Criar gráficos de barras e de dispersão
- Cálculo de uma área sob a curva (AUC)
Trabalhar com ficheiros .xls e .csv
- Importar dados de e exportar para o MS Excel / OpenOffice Calc
- Escrever ficheiros .xls e .csv
Utilizar Python para criar um pipeline de processamento de dados automatizado
Requisitos
Conhecimentos biológicos básicos sobre sequências de proteínas, ARN e ADN.
28 Horas
Declaração de Clientes (1)
A acessibilidade do formador e a capacidade de comunicação são muito eficazes,
Ciprian Ilie - Institutul National de Sanatate Publica
Curso - Programming for Biologists
Máquina Traduzida