Curso de Sequenciamento Genético e Testes

Este é um workshop prático que introduzirá os fundamentos da bioinformática. É destinado a pessoas com conhecimento básico em biologia e biologia molecular, que desejam aprender como processar e trabalhar com dados biológicos usando ferramentas computacionais. Foi especialmente projetado para:

• Pesquisadores que trabalham em laboratórios experimentais com macromoléculas biológicas, como proteínas, RNA e DNA.
• Cientistas cuja área de especialização principal não é a biologia, mas precisam lidar com dados biológicos.
• Gestores que estão introduzindo novos produtos (por exemplo, medicamentos) e querem ampliar seus conhecimentos sobre a bioinformática contemporânea.
• Programadores de computador que irão desenvolver programas para lidar com moléculas biológicas.

O curso está dividido em duas partes: teórica e prática. A palestra é intercalada com exercícios práticos simples, quizzes e testes para garantir que os participantes entendam os conceitos.

Durante o treinamento, faremos um tour guiado que abrange todos os aspectos básicos da análise de dados biológicos. Este workshop é uma oportunidade ideal para se familiarizar com a bioinformática e suas diversas faces! Ao final, você deverá ser capaz de enfrentar qualquer problema básico de bioinformática: saberá onde obter os dados necessários, como obter informações relevantes e como funcionam os softwares e algoritmos básicos. Nosso objetivo é facilitar sua compreensão dos dados biológicos.

Ao final do curso, você será capaz de trabalhar com dados biológicos usando ferramentas de bioinformática.

A genômica e metagenômica microbianas combinam tecnologias de sequenciamento e análise computacional para perfilar comunidades microbianas, caracterizar genomas e detectar traços funcionais como resistência antimicrobiana.

Este treinamento ministrado por instrutores (online ou presencial) é voltado para pesquisadores e bioinformáticos de nível iniciante a intermediário que desejam realizar análises práticas de dados de sequenciamento genômico e metagenômico microbiano.

Ao final deste treinamento, os participantes serão capazes de:

• Descrever fluxos de trabalho de sequenciamento comuns e formatos de arquivos-chave usados na genômica microbiana.
• Realizar controle de qualidade e pré-processamento de leituras brutas de NGS (Sequenciamento de Nova Geração).
• Executar perfis taxonômicos usando abordagens baseadas em marcadores e k-mers.
• Montar e anotar genomas microbianos e plasmídeos.
• Detectar SNPs, construir filogenias e interpretar a estrutura populacional.
• Prever genes de resistência antimicrobiana e resumir perfis funcionais.
• Usar fluxos de trabalho reprodutíveis com Conda, Docker e relatórios baseados em notebooks.

Formato do Curso

• Palestras introduzindo conceitos e ferramentas (20%).
• Sessões práticas práticas usando conjuntos de dados de exemplo (60%).
• Discussões abertas e análise orientada para que os participantes possam aplicar métodos aos seus próprios dados (20%).

Opções de Personalização do Curso

• Para solicitar um workshop personalizado focado em metagenômica clínica, ambiental ou industrial, entre em contato conosco para organizar.

Este treinamento presencial conduzido por um instrutor em Portugal (online ou presencial) é voltado para cientistas e qualquer pessoa interessada em aprender os fundamentos da nanociência e suas aplicações.

No final deste treinamento, os participantes serão capazes de:

• Compreender o campo das nanociências e nanotecnologias.
• Diferenciar aqueles na escala nano daqueles na escala micro.
• Conhecer a teoria fundamental de transferência de elétrons e energia.

Este é um curso prático, que mostra porque é que a programação é uma ferramenta poderosa no contexto da resolução de problemas biológicos. Durante o curso, os participantes aprenderão a linguagem de programação Python, uma linguagem considerada muito poderosa e fácil de usar. Este curso pode ser considerado como uma demonstração de como a bioinformática melhora a vida dos biólogos.

O curso foi concebido e destina-se a pessoas sem formação em informática que queiram aprender a programar.

Este curso é adequado para:

• Investigadores que lidam com dados biológicos.
• Cientistas que gostariam de aprender a automatizar tarefas quotidianas e a analisar dados.
• Gestores que queiram aprender como a programação melhora os fluxos de trabalho e a condução de projectos.

No final do curso, os participantes serão capazes de escrever programas curtos, que lhes permitirão manipular, analisar e lidar com dados biológicos e apresentar os resultados num formato gráfico.

Este curso tem como objetivo fornecer aos pesquisadores uma compreensão dos princípios de design e análise estatística e sua relevância para a pesquisa em uma variedade de disciplinas científicas.

Ele abrange alguns conceitos de probabilidade e métodos estatísticos, principalmente através de exemplos. Esta formação contém cerca de 30% de palestras, 70% de quizzes guiados e laboratórios.

No caso de cursos fechados, podemos adaptar os exemplos e materiais para uma área específica (como testes psicológicos, setor público, biologia, genética, etc...).

Nos casos de cursos públicos, são usados exemplos mistos.

Embora diversos softwares sejam utilizados durante este curso (Microsoft Excel até SPSS, Statgraphics, etc...) o foco principal está na compreensão dos princípios e processos que guiam a pesquisa, o raciocínio e as conclusões.

Este curso pode ser oferecido como um curso híbrido, ou seja, com deveres de casa e trabalhos.