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Programa do Curso
Introdução à linguagem de programação Python
- Por que Python?
- Usando Python para lidar com dados biológicos
- Trabalhando com o shell iPython
- Seu primeiro programa
- Escrevendo Python roteiros
- Importando módulos
Trabalhando com sequências de proteínas e RNA/DNA
- Encontrando motivos
- Transcrição e tradução in silico
- Tratamento de alinhamentos de sequência
Análise de dados em diferentes formatos biológicos
- Analisando FASTA
- Conversões de formato de dados
Executando análises biológicas
- EXPLOSÃO
- Accessing serviços web biológicos
Lidando com estruturas biológicas 3D usando Python
Python facilita a análise estatística
Visualizando dados
- Criação de gráficos de barras e dispersão
- Calculando uma área sob a curva (AUC)
Trabalhando com arquivos .xls e .csv
- Importando e exportando dados para MS Excel / OpenOffice Calc
- Gravando arquivos .xls e .csv
Usando Python para criar um pipeline de processamento de dados automatizado
Requisitos
Conhecimentos biológicos básicos sobre sequências de proteínas, ARN e ADN.
28 horas