Programa do Curso

Introdução à linguagem de programação Python

  • Por que Python?
  • Usando Python para lidar com dados biológicos
  • Trabalhando com o shell iPython
  • Seu primeiro programa
  • Escrevendo Python roteiros
  • Importando módulos

Trabalhando com sequências de proteínas e RNA/DNA

  • Encontrando motivos
  • Transcrição e tradução in silico
  • Tratamento de alinhamentos de sequência

Análise de dados em diferentes formatos biológicos

  • Analisando FASTA
  • Conversões de formato de dados

Executando análises biológicas

  • EXPLOSÃO
  • Accessing serviços web biológicos

Lidando com estruturas biológicas 3D usando Python

Python facilita a análise estatística

Visualizando dados

  • Criação de gráficos de barras e dispersão
  • Calculando uma área sob a curva (AUC)

Trabalhando com arquivos .xls e .csv

  • Importando e exportando dados para MS Excel / OpenOffice Calc
  • Gravando arquivos .xls e .csv

Usando Python para criar um pipeline de processamento de dados automatizado

Requisitos

Conhecimentos biológicos básicos sobre sequências de proteínas, ARN e ADN.

  28 horas
 

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